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JN江南体育科学家破译枸杞子基因组图谱

中国科学院生物物理研究所陈润生研究组结合陈畅研究组解析了枸杞基因组图谱和活性成份,初次揭露了枸杞果胶多糖(Lycium barbarum pectin polysaccharides,LBPPs)的完全生物合成路子,并判定了要害合成酶和糖代谢调控相干的RNA。相干论文近日颁发在《基因组学、卵白质组学和生物信息学》(Genomics, Proteomics Bioinformatics)。

枸杞作为中国传统的药食同源植物,含有丰JN江南·(中国区)体育官方网站-JN SPORTS硕的果胶多糖。枸杞果胶多糖是枸杞的首要生物活性成份,具有抗氧化、免疫调理、抗衰老等多种功能。虽然枸杞在健康范畴利用较多,但因为其贫乏切确的遗传图谱,致使LBPPs的合成进程和调控机制研究有限,这在很年夜水平上制约了枸杞的份子育种成长和国际推行。

该研究基在三代测序手艺、光学图谱手艺、自研高效三维基因组捕捉手艺等方式,对枸杞进行de novo的基因组组装,冲破枸杞基因组高杂合、高反复的瓶颈,取得枸杞高精度基因组图谱。在此根本上,解析了多糖活性酶基因库CAZymes在LBPPs合成中的焦点感化,特别是在枸杞果胶多糖骨架延长、侧链合成和链润色等方面的积累扩大。研究进一步判定了一个要害鼠李糖糖基转移酶基因RRT3020,其可以或许显著增进枸杞果胶多糖的生成。另外,该研究初度解析了与枸杞果胶多糖代谢相干的长链非编码RNA,为深切领会基因调控供给了新视角。团队初次在枸杞中成立了周全的果胶多糖合成路径,揭露了从糖转运到多糖润色的全部合成进程。

相干论文信息:https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzae079

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