JN江南体育蒲瓜基因组组装和果实生长发育调控研究获进展
广东省农业科学院蔬菜研究所瓜类研究一室与北京市农林科学院研究员左进华团队合作，在广东省农业科学院科技立异计谋专项资金（高程度农科院扶植）项目等的帮助下，研究揭露了蒲瓜基因组构成和进化关系和果实发展发育的份子调控机制。相干功效近日在线颁发在《园艺研究》（Horticulture Research）。
广东蒲瓜（Pugua）基因组组装。研究团队供图 ?
蒲瓜又称瓠瓜、葫芦、夜开花等，属在葫芦科葫芦属，原产在非洲撒哈拉以南地域，现已在全球多个地域普遍栽培。作为我国南边地域主要的特点瓜类蔬菜，蒲瓜的幼嫩果实口感清新，营养丰硕，含有丰硕的维生素、胆碱、萜类和黄酮等生物活性成份，具有潜伏的药用价值。但蒲瓜高质量基因组的缺少晦气在其相干份子机制的研究，阻碍了进一步的利用。
该研究经由过程连系PacBio HiFi、ONT超长读长测序和Hi-C测序数据，成功组装了蒲瓜的基因组，总长度为298.67 Mb。在11条染色体中，有7条实现了从端粒到端粒的无间隙组装，Contig N50到达了28.55 Mb，共注释出24,439个卵白编码基因。BUSCO评估显示，基因组的完全性到达了96.34%。经由过程基因组比力和系统发育阐发，发现蒲瓜与西瓜的亲缘关系比来，年夜约在14.3至32.38百万年前产生分化。
该研究还发现，赤霉素GA4和Aux/IAA家族基因在果实的膨年夜和成熟中起着介导感化。在细胞壁动态调控方面，XTHs和EXPs酶类阐扬了主要感化；在果实发育的初期阶段，首要以氨基酸和脂质的堆集为主，尔后期则以糖和萜类化合物的堆集为主。GGAT2基因的表达程度与蒲瓜中谷氨酸的堆集显现正相干性，而SUS5和SPS4基因的JN江南·(中国区)体育官方网站-JN SPORTS表达程度与蔗糖堆集程度相一致。
该研究成果为领会蒲瓜基因组的进化和果实发展发育的调控机制供给了主要的理论根本。
相干论文信息：https://doi.org/10.1093/hr/uhae335
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